国家铁路局（副部级）开行客货直通列车、办理军事运输和特殊货物运输审批；企业自备车辆参加铁路运输审批等职责被取消。该局起草铁路监督管理的法律法规、规章草案；组织或参与铁路生产安全事故调查处理等职责被强化。